錯構瘤的病因目前尚不十分明確，但是也可能會因為錯構瘤的患病部位出現(xiàn)差距。若是患有腎錯構瘤，其病因尚不十分明確，一般是因為遺傳、x染色體基因突變等因素引起的。若是肺錯構瘤，一般考慮與胚胎發(fā)育時期出現(xiàn)異常有關，會導致患者出現(xiàn)生長緩慢或者發(fā)展成瘤的情況。若是乳腺錯構瘤，一般考慮是胚胎期乳腺組織發(fā)育異常導致，也可能是因為分娩或者絕經期等特殊時期女性體內激素變化引起的。