亞急性甲狀腺炎的具體病因尚不明確，可能與感染、遺傳、自身免疫等因素有關(guān)。

1、感染

一種或多種病毒同時(shí)感染可能會(huì)繼發(fā)亞急性甲狀腺炎，如麻疹病毒、腺病毒、EB病毒、流感病毒、風(fēng)疹病毒等。

2、遺傳

若家族中有亞急性甲狀腺炎病史，其子女的發(fā)病率會(huì)有所升高，但存在地理分布與種族差異。

3、自身免疫

自身免疫功能紊亂的人群，會(huì)增加亞急性甲狀腺炎的發(fā)病率，發(fā)生機(jī)制尚未十分明了。