射精后小便疼痛可能是由多種原因引起的，如尿道感染、前列腺炎、尿道結石等，詳情如下：

1.尿道感染

尿道感染是常見的導致射精后小便疼痛的原因之一。細菌可從尿道口進入，引起炎癥，射精時會刺激局部組織，引起小便疼痛。

2.前列腺炎

前列腺是男性生殖系統(tǒng)中的重要器官，可以分泌液體幫助保護和滋潤精子。前列腺炎是前列腺組織的感染或炎癥，常常會導致射精后小便疼痛。除了疼痛，還可能伴有尿頻、尿急、會陰部不適等癥狀。

3.尿道結石

尿道結石是指在尿道內形成的結石或沉積物。當結石經過尿道時，會引起尿道刺激和疼痛。射精時尿道受到更大的刺激，因此會感到尿道疼痛。