陰莖根部疼考慮與感染有關，外陰清潔工作不到位、頻繁的手淫、性生活不注意衛(wèi)生以及性生活過度頻繁都會出現(xiàn)陰莖根部疼痛的情況。建議：口服消炎藥，注意外陰清潔衛(wèi)生，穿純棉透氣的內褲，疼痛時禁止性生活。

根據(jù)您的描述考慮是出現(xiàn)了生殖器炎癥，患有精索靜脈曲張曲張、生殖器皰疹、前列腺炎都會出現(xiàn)陰莖疼痛的現(xiàn)象。建議：日常注意個人衛(wèi)生，不抽煙喝酒，穿寬松的內褲，去醫(yī)院查明原因，對癥治療。