自身免疫性腦炎治愈率通常為30%到70%左右。

若自身免疫性腦炎患者自身病情較輕、及時(shí)進(jìn)行藥物治療，治愈率較高，通常為70%左右，常用藥物包括嗎替麥考酚酯膠囊、利妥昔單抗注射液、地塞米松磷酸鈉注射液等。若患者病情較重，且沒有得到及時(shí)有效的治療，此疾病治愈率較低，一般是30%左右。

已經(jīng)治愈的自身免疫性腦炎患者，可能遺留有神經(jīng)功能缺陷，家屬可以幫助患者進(jìn)行適量的關(guān)節(jié)被動(dòng)活動(dòng)，可以促進(jìn)關(guān)節(jié)、肌肉功能恢復(fù)。