食管囊腫是一種罕見的疾病，其形成原因尚不完全清楚，可能與食管黏膜損傷、食管肌肉功能異常、飲食習慣不良、遺傳因素等有關。

1、食管黏膜損傷

食管在運輸食物的過程中，需要不斷擴張和收縮，可能會導致食管黏膜損傷，使得黏液分泌增多，在食管內聚集，形成囊腫。

2、食管肌肉功能異常

如果食管肌肉功能異常，會導致食物在食管中滯留，從而為黏液的聚集提供了條件，最終形成囊腫。

3、飲食習慣不良

不健康的飲食習慣，如過多攝入高脂肪高膽固醇的食物、酗酒等，可能會導致食管黏膜損傷，從而引起食管囊腫的形成。

4、遺傳因素

部分食管囊腫可能與遺傳因素有關，臨床研究表明，有食管囊腫家族史的人群患病幾率較一般人群要高。