糞便樣本檢測(cè)利用分子生物學(xué)技術(shù)分析菌群種類(lèi)及豐度，不同年齡人群菌群有差異，飲食影響大，無(wú)創(chuàng)但需規(guī)范采集；唾液檢測(cè)基于唾液中菌群相關(guān)物質(zhì)，兒童易接受但可靠性稍低；血液檢測(cè)通過(guò)代謝物等間接反映，臨床應(yīng)用受限；組織活檢可直接觀察局部菌群但屬有創(chuàng)操作，特殊情況使用且兒童需謹(jǐn)慎評(píng)估優(yōu)先無(wú)創(chuàng)檢測(cè)。

一、糞便樣本檢測(cè)

通過(guò)收集受試者的糞便樣本，利用分子生物學(xué)技術(shù)（如16SrRNA基因測(cè)序）分析糞便中細(xì)菌、真菌等多種微生物的種類(lèi)及相對(duì)豐度。不同年齡人群糞便菌群組成存在差異，嬰幼兒腸道菌群處于動(dòng)態(tài)建立過(guò)程，老年人菌群多樣性可能降低；生活方式中飲食結(jié)構(gòu)會(huì)顯著影響糞便菌群，高纖維飲食有助于促進(jìn)有益菌生長(zhǎng)；該方法無(wú)創(chuàng)且能較全面反映腸道整體菌群概況，但需注意糞便采集的規(guī)范性，如避免污染等。

二、唾液檢測(cè)

采集唾液樣本，基于唾液中含有的少量腸道菌群相關(guān)微生物DNA或代謝產(chǎn)物來(lái)檢測(cè)腸道菌群。對(duì)于兒童等怕采集糞便樣本的人群較易接受，但唾液采集量及處理過(guò)程可能影響檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性，且唾液中的菌群相關(guān)物質(zhì)受多種因素干擾，其可靠性相對(duì)糞便檢測(cè)稍低。

三、血液檢測(cè)

檢測(cè)血液中與腸道菌群相關(guān)的代謝物或抗體等指標(biāo)間接反映腸道菌群狀態(tài)。血液中的相關(guān)物質(zhì)受腸道菌群影響的機(jī)制較為復(fù)雜，且單獨(dú)依靠血液檢測(cè)難以精準(zhǔn)定位腸道菌群的具體組成情況，臨床應(yīng)用相對(duì)受限。

四、組織活檢

通過(guò)內(nèi)鏡等手段獲取腸道組織樣本進(jìn)行檢測(cè)，可直接觀察腸道局部菌群情況，能提供更精準(zhǔn)的局部菌群信息，但屬于有創(chuàng)操作，一般在懷疑腸道局部有嚴(yán)重病變等特殊情況下使用，對(duì)于兒童等特殊人群，因有創(chuàng)操作風(fēng)險(xiǎn)需謹(jǐn)慎評(píng)估，優(yōu)先考慮無(wú)創(chuàng)的糞便樣本檢測(cè)等方式。