診斷肺結(jié)核最可靠的依據(jù)是痰結(jié)核菌檢查，包括痰涂片顯微鏡檢查（抗酸桿菌陽(yáng)性可高度懷疑但一次陰性不能排除需多次）、痰結(jié)核菌培養(yǎng)（敏感能定菌型做藥敏試驗(yàn)，培養(yǎng)出結(jié)核菌可確診）、分子生物學(xué)檢測(cè)（如PCR快速檢核酸，靈敏特異可助痰涂培養(yǎng)陰性者診斷）。

痰結(jié)核菌培養(yǎng)：此方法比涂片更敏感且能確定菌型并做藥物敏感試驗(yàn)。結(jié)核菌培養(yǎng)需要一定的時(shí)間和條件，但一旦培養(yǎng)出結(jié)核菌，就可以明確診斷為肺結(jié)核。例如，通過將痰液接種到特定培養(yǎng)基中，在適宜的溫度、濕度等條件下培養(yǎng)，若有結(jié)核菌生長(zhǎng)，即可確診。大量的臨床研究證實(shí)，痰結(jié)核菌培養(yǎng)陽(yáng)性是診斷肺結(jié)核的金標(biāo)準(zhǔn)之一，其準(zhǔn)確性較高，能夠明確患者是否感染結(jié)核菌以及結(jié)核菌的具體情況。

分子生物學(xué)檢測(cè)：如核酸擴(kuò)增試驗(yàn)（PCR）等，能快速檢測(cè)痰液等標(biāo)本中的結(jié)核菌核酸。它的優(yōu)勢(shì)在于靈敏度和特異性較高，能在短時(shí)間內(nèi)得到結(jié)果。不過，該方法也需要注意污染等問題對(duì)結(jié)果的影響。例如，利用PCR技術(shù)擴(kuò)增結(jié)核菌的特定核酸序列，若檢測(cè)到相應(yīng)序列則提示存在結(jié)核菌感染。相關(guān)研究顯示，分子生物學(xué)檢測(cè)在肺結(jié)核診斷中具有重要的輔助作用，尤其是對(duì)于痰涂片和培養(yǎng)陰性的可疑患者，能提高診斷的陽(yáng)性率。