基底核具有復雜的纖維聯(lián)系，主要構成三個重要的神經(jīng)環(huán)路
?、倨べ|-皮質環(huán)路
大腦皮質-尾殼核-內側蒼白球-丘腦-大腦皮質;
?、诤谫|-紋狀體環(huán)路
黑質與尾狀核、殼核間往返聯(lián)系纖維;
?、奂y狀體-蒼白球環(huán)路
尾狀核、殼核-外側蒼白球-丘腦底核-內側蒼白球健康搜索在皮質-皮質環(huán)路中有直接通路(紋狀體-內側蒼白球/黑質網(wǎng)狀部)和間接通路(紋狀體-外側蒼白球-丘腦底核-內側蒼白球/黑質網(wǎng)狀部)環(huán)路是基底核實現(xiàn)運動調節(jié)功能的解剖學基礎，這兩條通路的活動平衡對實現(xiàn)正常運動功能至關重要。
黑質-紋狀體DA通路變性導致基底核輸出過多，丘腦-皮質反饋活動受到過度抑制使皮質運動功能易化作用受到削弱，產(chǎn)生少動性疾病如帕金森病紋狀體神經(jīng)元變性導致基底核輸出減少丘腦-皮質反饋對皮質運動功能易化作用過強，產(chǎn)生多動性疾病如亨廷頓病。
因此，基底核遞質生化異常和環(huán)路活動紊亂是產(chǎn)生各種運動障礙癥狀的主要病理基礎。運動障礙性疾病治療無論藥物或外科治療原理都基于對遞質異常和環(huán)路活動紊亂的糾正。