病因未明，部分病例為遺傳因素，且有隔代遺傳現(xiàn)象。環(huán)境因素對(duì)胚胎發(fā)育過程中的影響，如某些藥物、病毒性感染、外傷、放射性物質(zhì)的刺激等，特別是近代工業(yè)的污染，都可成為致畸因素。肢芽胚基分化早期受損害，是導(dǎo)致多指畸形的重要原因。拇指多指畸形即是由于外胚層頂脊的發(fā)育異常，拇指?jìng)?cè)頂向近位延長及其退縮遲緩所致。
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