色素絨毛結節(jié)性滑膜需要與可發(fā)生關節(jié)腫脹，關節(jié)積液，關節(jié)骨破壞的關節(jié)疾病相鑒別。色素絨毛結節(jié)性滑膜炎的軟組織腫脹呈密度較高的結節(jié)狀，且以關節(jié)腔內為主，無骨質疏松，骨缺損邊緣硬化，關節(jié)間隙保持正常有助于與關節(jié)結核、滑膜炎、滑膜肉瘤、類風濕性關節(jié)炎等疾病的鑒別。鈣化多見于結核、滑膜肉瘤，但也不可完全排除色素絨毛結節(jié)性滑膜炎，應該把鈣化放在所有征象中綜合分析，這樣才能減少誤診。
?、傧目剖详P節(jié)：早期都出現(xiàn)關節(jié)腫脹、積液、無痛等，但多數(shù)有外傷史，關節(jié)畸形較嚴重。X線所見新骨形成，骨端瓦解，關節(jié)面破壞，關節(jié)脫位等骨關節(jié)損害與臨床癥狀極不相符。
?、诨と饬觯憾呔熊浗M織腫塊，鈣化、骨質破壞，但滑膜肉瘤發(fā)展快、病程短、劇痛、骨質破壞呈溶解性，無硬化邊緣。
?、刍そY核：二者均有關節(jié)周圍組織腫脹，關節(jié)面破壞，關節(jié)間隙早期增寬晚期狹窄。其不同點結核有明顯骨質疏松，關節(jié)面破壞累及兩側，無硬化之邊緣，軟組織中無腫塊影。
④類風濕性關節(jié)炎單關節(jié)型：多見于肘、腕、膝、指關節(jié)，關節(jié)腫脹，軟組織增厚，疼痛不甚明顯。較早出現(xiàn)骨質疏松、關節(jié)間隙變窄甚或蟲蝕樣破壞。關節(jié)穿剌為透明液。